MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.01

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018066	TTA	2	6	66	71	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018066	T	6	6	84	89	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018066	TTTGG	2	10	105	114	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018066	TAAT	2	8	127	134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018066	GAT	2	6	161	166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018066	TTA	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018066	TAG	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018066	AGG	2	6	4843	4848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018066	TTA	2	6	4986	4991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018066	TTA	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018066	T	9	9	5275	5283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018066	TAA	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018066	AGG	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018066	ACA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018066	GTT	2	6	5557	5562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018066	CGC	2	6	5580	5585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018066	AATT	2	8	5636	5643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018066	A	8	8	5650	5657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018066	ACA	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018066	GAT	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018066	AAT	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018066	TAT	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018066	ATT	2	6	7003	7008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018066	AGC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018066	CAG	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018066	AAG	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018066	TTTG	2	8	7346	7353	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018066	TTC	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018066	AGGG	2	8	7436	7443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018066	GTT	2	6	7782	7787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018066	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018066	TATT	2	8	7829	7836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018066	AAATT	2	10	8857	8866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018066	GAT	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018066	GAA	2	6	9303	9308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018066	TTC	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018066	TAAA	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018066	AG	3	6	10259	10264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018066	T	7	7	12205	12211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018066	T	7	7	17980	17986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018066	CTAAT	2	10	18027	18036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018066	T	6	6	18041	18046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018066	ATTA	2	8	18068	18075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018066	AG	3	6	18090	18095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018066	ACG	2	6	18872	18877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018066	ATA	2	6	18893	18898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018066	AGA	2	6	18912	18917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018066	T	8	8	18975	18982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018066	CTT	2	6	18998	19003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018066	T	6	6	19011	19016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018066	ATTT	2	8	19064	19071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018066	CA	3	6	19075	19080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018066	TA	3	6	19085	19090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018066	A	6	6	19097	19102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018066	GTT	2	6	19111	19116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018066	TTGAA	2	10	20823	20832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018066	AT	3	6	21630	21635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018066	AG	3	6	21997	22002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018066	T	7	7	23062	23068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018066	GAG	2	6	23092	23097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018066	AAG	2	6	23385	23390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018066	TGA	2	6	23538	23543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018066	TGAG	2	8	23577	23584	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018066	TCC	2	6	23637	23642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018066	CGA	2	6	23665	23670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018066	T	6	6	23696	23701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018066	TGC	2	6	23732	23737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018066	TTG	2	6	23787	23792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018066	GAG	2	6	23802	23807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018066	AGG	2	6	23829	23834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018066	GTC	2	6	23932	23937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018066	GGA	3	9	23952	23960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018066	ACG	2	6	23975	23980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018066	G	6	6	23980	23985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018066	C	6	6	24009	24014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_018066	TGA	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018066	A	7	7	24053	24059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018066	T	8	8	24066	24073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018066	TCA	2	6	24123	24128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018066	GTG	2	6	24149	24154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018066	T	6	6	24189	24194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018066	CTATA	2	10	24228	24237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018066	AGG	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018066	GGGA	2	8	24432	24439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018066	TTCG	2	8	24505	24512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018066	TATT	2	8	24529	24536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018066	TGC	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018066	TGT	2	6	24614	24619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018066	AG	4	8	24968	24975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018066	AG	3	6	24980	24985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018066	TAC	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018066	AG	3	6	25810	25815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018066	AG	3	6	25857	25862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018066	TTA	2	6	25928	25933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018066	TATTT	3	15	26009	26023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018066	CTTTT	2	10	26040	26049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018066	CCT	2	6	27009	27014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018066	TAT	2	6	27082	27087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018066	T	7	7	27136	27142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018066	GGA	2	6	27164	27169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018066	GAT	2	6	27170	27175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018066	AGG	2	6	27900	27905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018066	T	7	7	28519	28525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018066	AAC	2	6	29362	29367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018066	A	6	6	29380	29385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018066	CTA	2	6	30196	30201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018066	TAG	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018066	ATT	2	6	30318	30323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018066	AAC	2	6	30390	30395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018066	GTA	2	6	30404	30409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018066	TAGAT	2	10	30541	30550	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018066	T	6	6	30814	30819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018066	ACA	2	6	30909	30914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018066	AG	3	6	30966	30971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018066	GAT	2	6	31005	31010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018066	CT	3	6	31779	31784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018066	AT	3	6	31790	31795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018066	CTT	2	6	31802	31807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018066	TA	3	6	31817	31822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018066	ATT	2	6	31908	31913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018066	AATG	2	8	31942	31949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018066	TAT	2	6	31993	31998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018066	CCT	2	6	32761	32766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018066	ATT	2	6	32833	32838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018066	ACTTT	2	10	32883	32892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018066	ACA	2	6	32902	32907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018066	TA	3	6	32915	32920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018066	TCT	2	6	32946	32951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018066	AAT	2	6	32970	32975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018066	TAA	2	6	33054	33059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018066	TA	3	6	35001	35006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018066	TAC	2	6	35014	35019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018066	AT	3	6	35027	35032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018066	TCT	2	6	35040	35045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018066	ATA	2	6	35049	35054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018066	TGG	2	6	35147	35152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018066	TAA	2	6	35193	35198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018066	CAA	2	6	35204	35209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018066	TCCT	2	8	35248	35255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018066	ATAG	2	8	35262	35269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018066	GATAA	2	10	35282	35291	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018066	A	6	6	35317	35322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018066	CCT	2	6	35338	35343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_018066	AT	3	6	35374	35379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018066	AAAAAG	2	12	35407	35418	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018066	T	6	6	35436	35441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018066	TC	3	6	35499	35504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018066	TTACT	2	10	35558	35567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018066	T	7	7	35580	35586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018066	CTTTT	2	10	37081	37090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018066	ATT	2	6	37123	37128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018066	TGGT	2	8	37163	37170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018066	TCCT	2	8	37367	37374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_018066	TCC	2	6	37403	37408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_018066	T	6	6	37436	37441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018066	TGAG	2	8	38120	38127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018066	TCC	2	6	38180	38185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_018066	TAT	2	6	38239	38244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018066	GTA	2	6	38335	38340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018066	GA	3	6	38381	38386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_018066	T	7	7	38877	38883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_018066	TGA	2	6	39341	39346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_018066	CATA	2	8	58156	58163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.